ทีมเต่าของนินจามีศัตรูที่ร้ายแรงมาก เขาชื่อ ซาวันตี โรเมโร วายร้ายคนนี้สร้างไทม์แมชชีนและตอนนี้รวบรวมสัตว์ประหลาดจากทุกภพทั้งในอดีตและอนาคต เพื่อรวมพวกมันเป็นกองทัพวายร้ายขนาดใหญ่ ฮีโร่ต้องแทรกแซงแผนการของศัตรู ในการทำเช่นนี้ พวกเขาจะต้องไปทุกแห่งที่โรเมโรวางแผนจะไป และทำให้ทุกคนที่เขาพยายามจะหันไปหาเขาเป็นกลาง ไมค์ ราฟาเอล ลีโอ และโดนัลด์ พร้อมสำหรับการเดินทางที่อันตราย คุณต้องเลือกผู้สมัครคู่แรก พวกเขาจะย้ายไปอียิปต์โบราณ ที่นั่นพวกเขาจะพบกับมัมมี่ที่ชั่วร้าย Dracula และซอมบี้กำลังรอพวกเขาอยู่ในสถานที่อันตรายอื่น ๆ ของเกม Teenage Mutant Ninja Turtles Monsters Vs Mutants