นินจาผู้กล้าหาญเกียวโตได้รับงานจากหัวหน้าคำสั่งของเขาและคุณในเกม Super Ninja Hero จะต้องช่วยเขาทำสำเร็จ ฮีโร่ของคุณจะต้องเข้าไปในปราสาทของขุนนางคนหนึ่งผ่านดันเจี้ยนและขโมยเอกสารสำคัญจากที่นั่น ดันเจี้ยนทั้งหมดจะเป็นอุปสรรคต่อเนื่อง คุณควบคุมฮีโร่ของคุณอย่างคล่องแคล่วจะต้องเอาชนะพวกเขาทั้งหมด นอกจากนี้ ฮีโร่ของคุณจะต้องต่อสู้กับสัตว์ประหลาดและทหารคุ้มกันต่าง ๆ ที่อยู่ในเขาวงกตนี้ ระหว่างทาง คุณจะต้องรวบรวมสิ่งของและอาวุธต่างๆ ที่กระจัดกระจายอยู่ทั่วไป
