ในเกม Ninja vs Ninja ใหม่ คุณจะไปยังโลกที่ผู้คนในกล่องอาศัยอยู่ มีสงครามระหว่างสองคำสั่งนินจาและคุณจะเข้าร่วมหนึ่งในนั้น ตัวละครของคุณเป็นคนกล่องแดง เขาจะอยู่ในห้องที่คู่ต่อสู้ของเขาเป็นสีฟ้า ระหว่างพวกเขาจะอยู่อุปสรรคและกับดักต่างๆ คุณจะต้องแนะนำตัวละครของคุณผ่านอันตรายเหล่านี้และโจมตีคู่ต่อสู้ของคุณ การใช้อาวุธขว้างปาต่างๆ คุณทำลายศัตรูและรับคะแนนจากมัน
