สิ่งมีชีวิตตัวน้อยที่ตลกชื่อ Jojo อาศัยอยู่ในส่วนลึกของป่า อยู่มาวันหนึ่ง ฮีโร่ของเราได้ยินว่าเหรียญทองคำปรากฏขึ้นในที่ห่างไกลในยามค่ำคืน ตัวละครของเราตัดสินใจที่จะไปสถานที่เหล่านั้นและรวบรวมพวกเขาทั้งหมด คุณในเกม Jojo Run จะช่วยเขาในเรื่องนี้ ตัวละครของคุณจะวิ่งไปตามเส้นทางด้วยขาของเขาทั้งหมด ระหว่างทาง เขาจะได้พบกับความล้มเหลวของพื้นดิน กับดัก และสิ่งมีชีวิตต่างๆ ที่สามารถฆ่าเขาได้ เมื่อเข้าใกล้อันตรายเหล่านี้ คุณจะต้องทำให้ฮีโร่กระโดดและบินผ่านมันไปในอากาศ ระหว่างทางคุณจะต้องรวบรวมเหรียญเหล่านี้ทั้งหมด