ในเกม Ninja Run ใหม่ คุณจะต้องช่วยนินจาผู้กล้าหาญทำภารกิจหัวหน้าตามคำสั่งของเขาให้สำเร็จ ฮีโร่ของคุณจะต้องบุกเข้าไปในพื้นที่คุ้มครองและรวบรวมดาววิเศษที่ปรากฏที่นั่นในช่วงเวลาหนึ่ง ฮีโร่ของคุณจะวิ่งไปตามถนนค่อยๆ เพิ่มความเร็ว ทันทีที่คุณสังเกตเห็นดวงดาว พยายามรวบรวมมัน ระหว่างทางคุณจะพบกับอุปสรรคและกับดักประเภทต่างๆ คุณควบคุมฮีโร่ของคุณจะต้องกระโดดข้ามพวกเขา หากคุณไม่มีเวลาตอบสนอง ฮีโร่ของคุณจะตายและคุณจะผ่านด่านไม่ได้
