โซนิคพร้อมกับเพื่อน ๆ ตัดสินใจเข้าไปในป่าลึกเพื่อค้นหาวัดโบราณซึ่งตามตำนานเล่าว่าขุมทรัพย์ของอารยธรรมมายาที่สูญหายนั้นถูกซ่อนไว้ คุณในเกม Sonic 2 Heroes จะช่วยพวกเขาในการผจญภัยครั้งนี้ ก่อนที่คุณจะอยู่บนหน้าจอ คุณจะเห็น Sonic พร้อมกับเพื่อน ๆ ของเขา ซึ่งจะอยู่ที่จุดเริ่มต้นของเส้นทาง คุณสามารถใช้ปุ่มควบคุมเพื่อควบคุมอักขระทั้งหมดได้ในครั้งเดียว คุณจะต้องทำให้พวกเขาวิ่งไปข้างหน้า ระหว่างทางจะมีรูบนพื้นและสิ่งกีดขวางที่มีความสูงต่างกัน คุณจะต้องทำให้ฮีโร่กระโดดข้ามช่องว่างและปีนสิ่งกีดขวางด้วยความเร็ว หากคุณเข้าไปขวางทางเหรียญทอง คุณจะต้องรวบรวมมัน