นินจาตัดสินใจยืดขาของเขาและวิ่งไปรอบ ๆ เมืองเพื่อเก็บเหรียญ ในเกม Ninja Runner คุณจะได้พบกับฮีโร่และช่วยเขาจัด parkour เมือง ฮีโร่ไม่มีความสูงที่ผ่านไม่ได้ คุณสามารถคลิกที่ผู้ชายได้หลาย ๆ ครั้งแล้วเขาจะกระโดดไปยังจุดสูงสุด: แท่น, หอคอยและยอดเขาอื่น เมื่อวิ่งผ่านด่านนี้ไป คุณสามารถไปยังด่านอื่นได้ แต่ระวัง ในระดับใหม่จะมีอุปสรรคเพิ่มเติมในรูปแบบของหนามแหลมที่คุณไม่จำเป็นต้องกระโดดขึ้นไปเพื่อไม่ให้เสียหัวใจ มีอุปสรรคที่เฉียบคมมากขึ้นเรื่อยๆ ซึ่งหมายความว่าคุณจะต้องรวดเร็วและว่องไวในการกอบกู้นินจาจากการสูญเสียชีวิตใน Ninja Runner
