ไม่มีใครโต้แย้งความสำเร็จของTeenage Mutant Ninja Turtles และ Power Rangers อย่างไรก็ตาม พวกเขาไม่สามารถตกลงกันได้และแต่ละกลุ่มก็อ้างว่าตัวเองเหนือกว่า เพื่อค้นหาว่าใครเก่งที่สุด เหล่าฮีโร่ตัดสินใจที่จะจัดการต่อสู้กันเอง และพวกเขาจะเริ่มต้นทันทีที่คุณเข้าสู่เกม Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash คุณเลือกนักสู้ที่จะเป็นคนแรกที่เข้าสู่เวที หลังจากการรบต่อเนื่องกัน ผู้ชนะควรเหลือไว้เพียงหนึ่งเดียว ไม่มีใครบังคับให้คุณต้องรูทเพื่อใครซักคน คุณเลือกฮีโร่ให้ตัวเองและจะส่งเสริมฮีโร่นั้น ช่วยเอาชนะคู่แข่งทั้งหมดใน Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash