ชายผู้มีพลังวิเศษอย่างสไปเดอร์แมนไปรับราชการในหน่วยข่าวกรองต่างประเทศและกลายเป็นสายลับพิเศษอย่างเจมส์ บอนด์ แต่เขาไม่ต้องการอาวุธ เขารับมือกับศัตรูได้ สิ่งที่ปล่อยใยออกจากหัวเรือและพันศัตรูด้วยมันทำให้เขาไม่สามารถเคลื่อนที่ได้อย่างสมบูรณ์ ใน Mutant Assassin 3D คุณจะช่วยให้ฮีโร่ทำภารกิจให้สำเร็จโดยกำจัดตัวแทนศัตรูที่ไม่ต้องการ กลไกการทำลายล้างนั้นง่ายมาก: คุณเล็งวงกลมสีเขียวไปที่ตัวร้ายสีแดงตัวถัดไปแล้วปล่อยเว็บ มันพันรอบร่างกายและศัตรูก็พ่ายแพ้ ในทำนองเดียวกัน คุณจะต้องรวบรวมเงินจำนวนมาก ซึ่งจะต้องถูกรวบรวมเพื่อที่จะผ่านด่านใน Mutant Assassin 3D
