ขณะสืบสวนอีกคดีหนึ่ง ฮีโร่ของเกม Mystery Subway Escape 2 นักสืบไมเคิล ได้พบทางเข้าลับไปยังสถานีรถไฟใต้ดินที่ถูกทิ้งร้าง น้อยคนที่รู้เกี่ยวกับพวกเขา เราไม่ได้พูดถึงอุโมงค์ทางเทคนิค แต่เกี่ยวกับสถานีที่เคยเปิดดำเนินการ แต่ด้วยเหตุผลใดก็ตามกลับกลายเป็นว่าถูกปิดและไม่มีการอ้างสิทธิ์ มีอุปกรณ์ สิ่งของ และสิ่งของเหลืออยู่บ้างที่ไม่ได้ทิ้งเพราะอาจยังมีประโยชน์อยู่ ที่นั่นฮีโร่ของเราจะมองหาหลักฐานแล้วหาทางออกเนื่องจากประตูที่เขาเข้าไปนั้นถูกล็อคโดยใครบางคนใน Mystery Subway Escape 2 เห็นได้ชัดว่าพวกเขากำลังจับตาดูเขาอยู่และตัดสินใจกำจัดนักสืบผู้พิถีพิถันคนนี้ออกไป