ฮีโร่ของเกม Dark Dino Runner คือไดโนเสาร์พิกเซล เขาต้องการหาที่พักพิงเพื่อเอาชีวิตรอดจากยุคน้ำแข็ง ถ้ำที่น่าเชื่อถือที่สุดคือถ้ำบนภูเขา แต่คุณต้องไปให้ถึงถ้ำเหล่านั้น เส้นทางทอดยาวผ่านทะเลทราย แต่ในระหว่างวันมีความร้อนอบอ้าวที่นั่น และไดโนจะไม่สามารถวิ่งได้แม้แต่หนึ่งกิโลเมตรโดยไม่หมดแรงเพราะความเหนื่อยล้า พระเอกจึงตัดสินใจเดินทางต่อในตอนกลางคืนซึ่งอากาศไม่ร้อน ในทะเลทรายตอนกลางคืนอากาศหนาวเย็น ดังนั้นไดโนจะวิ่งเร็วขึ้นเพื่อรักษาความอบอุ่น และคุณจะช่วยให้เขากระโดดข้ามกระบองเพชรขนาดใหญ่ที่จะเจอระหว่างทางใน Dark Dino Runner