จุดสีแดงและสีน้ำเงินต้องการชนกัน แต่ไม่มีแขนหรือขาที่จะเคลื่อนไหวได้ แต่จุดนั้นกลม ซึ่งหมายความว่าพวกมันสามารถหมุนได้ คุณต้องใช้ดินสอวิเศษและความฉลาดของคุณ หากต้องการให้จุดต่างๆ เข้าใกล้กัน ให้ลากเส้นหรือรูปร่างเพื่อให้ลูกบอลกลิ้งลงมาและชนกัน ผ่านด่านต่างๆ หกด่านแรกมีอยู่แล้วและคุณสามารถเลือกด่านใดก็ได้ คุณต้องผ่านทุกอย่างเพื่อเข้าถึงด่านที่เหลือใน Brain Dots โดยไม่ต้องทำตามลำดับ