นอกจากการเปลี่ยนแปลงในแต่ละวันรอบเมืองแล้ว Spider-Man ยังมีภารกิจลับในการควบคุมความสงบสุขของชาวเมืองอีกด้วย สมาชิกของรัฐบาลและหน่วยงานต่างๆ ประเทศที่เกี่ยวข้องกับความปลอดภัย พวกเขาหันไปหาซูเปอร์ฮีโร่เพื่อขอความช่วยเหลือในเรื่องที่ยากและสำคัญเป็นพิเศษซึ่งคนธรรมดาไม่สามารถรับมือได้ ในเกม Spider-man vs Robot คุณจะได้พบกับฮีโร่ที่เพิ่งทำภารกิจพิเศษเช่นนี้ เขาต้องแทรกซึมฐานลับที่ผู้ก่อการร้ายระดับโลกได้ตั้งรกรากและทำลายมัน แต่วิธีการไปยังฐานได้รับการปกป้องอย่างระมัดระวังและฮีโร่จะต้องเผชิญหน้ากับหุ่นยนต์และซอมบี้ทั้งฝูงใน Spider-man vs Robot
