Spider-Man มีสิ่งผิดปกติเกิดขึ้นบางครั้งโดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อเร็ว ๆ นี้ เขาสามารถไปนอนในบ้านของเขาและตื่นขึ้นมาในที่ที่ต่างไปจากเดิมอย่างสิ้นเชิง นี่เป็นเวทย์มนตร์หรือเทคโนโลยีขั้นสูงบางอย่าง คุณต้องค้นหาก่อนที่จะเลวร้ายลง ในเกม Marvel Ultimate Spider-man Mystery City คุณและซูเปอร์ฮีโร่จะพบว่าตัวเองอยู่ในเมืองลึกลับที่ไม่ได้อยู่ในแผนที่ เป็นไปได้มากว่าเขาอยู่ในจักรวาลคู่ขนาน Spider-Man ต้องการทำความเข้าใจว่าเขาถูกส่งตัวไปในอวกาศอย่างไรและทำไมถึงมาที่นี่ เพื่อเคลื่อนตัวไปรอบเมือง จำเป็นต้องกระโดดและลงจอดบนกระเบื้องสีน้ำเงิน มิฉะนั้น ฮีโร่อาจได้รับบาดเจ็บใน Marvel Ultimate Spider-man Mystery City
