อาณาจักรเห็ดได้รับการรุกรานจากเอเลี่ยน หุ่นยนต์เอเลี่ยนเดินไปตามชานชาลาและถนน ข่มขู่ผู้อยู่อาศัยทั้งหมดด้วยกรงเล็บเหล็กของพวกมัน มาริโอเป็นคนเดียวที่สามารถต้านทานผู้รุกรานได้ เขากินเห็ดไปแล้ว กลายเป็นซูเปอร์มาริโอตัวใหญ่ ติดอาวุธด้วยค้อนและหิน และพร้อมที่จะต่อสู้ ช่วยฮีโร่ เขาจะเคลื่อนที่ได้เร็วพอ และคุณโดยการคลิกที่ปุ่มที่เลือกที่มุมล่างขวา ทำให้เขาต้องขว้างก้อนหินหรือทุบศัตรูด้วยค้อน ดีกว่าที่จะขว้างก้อนหินใส่หุ่นยนต์ที่ใหญ่กว่า และสำหรับคนตัวเล็ก ๆ การกระแทกหัวอย่างแรงใน Super Mario Run ก็เพียงพอแล้ว